Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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