Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PtpraP18052 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms