Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms