Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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H2-M1F7CXU4 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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H2-M1F7CXU4 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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H2-M1F7CXU4 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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H2-M1F7CXU4 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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H2-M1F7CXU4 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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H2-M1F7CXU4 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M1F7CXU4 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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