Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms