Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms