Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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