Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SrpraQ9DBG7 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SrpraQ9DBG7 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms