Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rprd1bQ9CSU0 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms