Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hps4Q99KG7 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hps4Q99KG7 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Hps4Q99KG7 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps4Q99KG7 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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