Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms