Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg9aQ68FE2 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms