Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms