Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Puf60Q3UEB3 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms