Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms