Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp39Q3TIX9 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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