Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Bop1P97452 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms