Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Pkp1P97350 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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