Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms