Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Chd1P40201 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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