Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm2035J3QP87 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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