Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc175E9PVB3 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms