Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CtcflA2APF3 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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