Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms