Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SrfQ9JM73 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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