Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms