Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms