Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Pop5Q9DB28 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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Pop5Q9DB28 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Pop5Q9DB28 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Pop5Q9DB28 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Pop5Q9DB28 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Pop5Q9DB28 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Pop5Q9DB28 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms