Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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