Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.9 ms