Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms