Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.2 ms