Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Usp39Q3TIX9 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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Usp39Q3TIX9 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp39Q3TIX9 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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