Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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