Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ttc39dQ0VF76 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms