Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RxraP28700 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RxraP28700 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms