Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms