Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CtcflA2APF3 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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