Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Hdac6Q9Z2V5 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms