Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Rabgef1Q9JM13 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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