Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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