Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Use1Q9CQ56 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms