Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PtprtQ99M80 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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