Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ddb2Q99J79 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ddb2Q99J79 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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