Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prpf39Q8K2Z2 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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