Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp49Q6P9L4 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp49Q6P9L4 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp49Q6P9L4 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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