Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms