Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms