Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Q3U6N9 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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