Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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